La historia del manga se centra en Chrono, un niño cuyo ojo derecho está dotado del "Rebobinador", un poder para retroceder el tiempo. Pertenece a una unidad especial de la policía del tiempo que frustra destinos oscuros retrocediendo en el tiempo y alterando la historia. La historia sitúa a Chrono en diversas misiones, como romance, deportes y la prevención de atentados terroristas​.